¿Qué son las secuencias PAM?

FAQs об исследованиях
La molécula guía contiene una secuencia (protoespaciador) que es complementaria del segmento de ADN objetivo. Inmediatamente adyacente a este protoespaciador hay otra corta secuencia crítica conocida como motivo adyacente del protoespaciador (PAM). El PAM es distinto del componente de la secuencia objetivo complementaria del ARNsg y se encuentra aguas abajo del sitio objetivo que se encuentra en el ADN genómico.1 Al construir moléculas guía ARNsg, la secuencia PAM se debe posicionar en el extremo 3' de la secuencia objetivo de ADN después de las secuencias de ARNcr y ARNtracr. El mecanismo de la nucleasa Cas9 tiene inicio cuando reconoce el PAM y procede a desestabilizar las secuencias adyacentes para permitir en emparejamiento de ADN con la secuencia complementaria que se encuentra en el RNAsg.

Referencia:
1. C. Anders, et al., “Structural basis of PAM-dependent target DNA recognition by the Cas9 endonuclease,” Nature 513(7519):569-573, 2014.